只不过，不知是受哪位高人指点，段祺瑞召集他的亲信举行秘密会议后，大家又把军事政变改为军事威胁。或许是现在留着冯还有用，或许怕把冯逼得无路可而狗急跳墙，挑起皖、直开战甚至直系和西南联合起来对付皖系。
他们的新计划是早日召集新国会，以便提早改选总统，合法倒冯。
这些举措肯定是明智之举。
只要不被逼到死路，冯国璋都是选择妥协。很快，他被迫公布了临时参议院所修正的国会组织法与两院议员选举法，并命令内务部筹备新国会的选举。
段祺瑞已经不甘于名不正言不顺，要直接抓内阁的权了，便发动倒阁。王士珍正求之不得，就坡下驴。提出辞呈后即不到院办公。冯国璋勉强地派内务总长钱能训代理内阁总理。
二月二十四日京奉路火车被奉军扣留运兵。
二十五日奉军第廿七师第五十三旅开到滦州，奉天军署参谋长杨宇霆带兵到秦皇岛，把日本政.府根据中日军械借款协定，第一批运到的二万七千余只步枪劫走。
消息传到北京，冯国璋和段祺瑞同感震惊，尤其是段祺瑞。向日本借款购买的这批军械是为了训练自己嫡系部队“参战军”的，如今却被奉军捷足先登。
二十六日段祺瑞电张作霖请“原物交还”，运来北京。张也在同一天发出通电，说他早已布置南征，因缺乏军火，而未便开拔。现在未经呈报即提去军火，因怕往返请示费时，所以不得已先留用后呈报。
二十七日他答复段说：“此次奉天请领军械，系奉元首讨伐明令，整饬军队，为政.府之后盾。所练军队，无论对内对外，均属拥护中央，一旦编练成军，悉听政.府驱策，运京留奉，宗旨无殊。盖全军均属国家，尚何器械之足计？”
张作霖并不是擅自劫取军火，因为他并不知道这批军火抵达秦皇岛。那么是谁暗示张作霖的呢？原来是徐树铮。
小徐奉命到关外召奉军入京，他知道如不许以重利，张作霖不会奉召的。而事实上奉军不入关，北京局势不会一面倒向皖系。
可是段祺瑞为人刚愎，事先如果向他请示，他一定不许，唯有用行动先做了再说。小徐做过陆军部次长，知道购买日本军火的详情。而在他交卸次长职以前，曾留下好几张盖了印信关防的陆军部空白公文纸。他用劫取这批军火作为交换条件换张作霖派兵入关，奉军即是持小徐发给的假陆军部证件去劫取这批军火的。
奉军入关后，张作霖完全迎合皖系，高调提出罢免李纯和讨伐冯玉祥两个要求，他说这是为了“拥护元首”。可是，被他拥护的元首却吓得惊慌失措。
二十六日，冯国璋在总统府召集紧急会议讨论奉军入关的对策，段祺瑞参加了会议。
冯质问段：“这次奉军出兵入关事前既未奉令，也未呈报，居心何在？”
段答不知。冯又大声问：“前任陆军次长徐树铮到奉天作何勾结？”
段更无言以答。
这次会议当然无果而终。
冯国璋想要段祺瑞叫张作霖退兵，段就是召奉军入关的始作俑者，他怎肯要奉军退出呢？何况请神容易送神难，他即使想叫张退兵，事实上也办不到了。
段何尝不知道关外王张作霖不是好惹的，请了来就不容易请出去，可为了饮鸩止渴，也只能走一步说一步了。
冯国璋知道叫段祺瑞退奉军是办不到了，他只得央请前清末年做过东三省总督，亲手招抚过张作霖的赵尔巽，到奉天说服张作霖退兵。然而时过境迁，张作霖早就不买他老上司的账了，赵尔巽自然是白跑一场。
冯国璋现在是一个光杆总统，内阁总理虽由钱能训代理，可是钱不肯代下去，天天闹着要交差。冯写信给杨士琦，想请他出山，杨连信都不回。而皖系督军们，眼中根本没他这个总统。惶惶不可终日的冯国璋，心灰意冷，拟就如下致各省军政首长通电：
“国步屯邅，日甚一日，内则蜩螗羹沸，干戈之劫难回，外则惨淡风云，边境之防日亟。剥肤可痛，措手无从。国璋代行职权，已逾半载，凡所设施，力与愿违，清夜扪心，能无愧汗？然国璋受国民付托，使国家竟至于此，负罪引慝，亦何必哓哓申诉，求谅国人。但揆其所以致此之由，与夫平日之用心，为事实所扞格，屡投而不得一当者，缘因复杂，困难万端。欲避贤求去，苦无法律之可循；欲忍辱图全，又乏津梁之可济。长此悠忽，必召沦胥。诸君子为国干城，同负责任，用特披沥肝鬲，为一言之。
“溯自京畿变生，国祚半斩，元首播越，举国骚然。于是黄陂委托于前，段前总理敦促于后，皆援副总统代职之规定，强国璋以北来，明知祸乱方殷，菲材绝难负荷，惟冀黄陂复职，主持有人，则不佞捍卫南疆，尚可分担艰钜。乃商请无效，各省区督军省长、及文武官吏，分驰电牍，敦促入都。猥以藐躬，过承督责，汤火之蹈，且不容辞，矧安危不仅系于个人，匡助可取资群力乎？惊涛共济，全恃同舟，初不料玺绶方承，而内部转愈趋纷扰也。
“国璋抵京，首先奉政黄陂，不获许可，而后受职。其时国会早经解散，政.府尚在板舆，继绝布新，有同草创。段前总理投艰遗大，独任贤劳，正宜共济时艰，中外一致，而西南诸省，忘再奠共和之绩，以非法内阁相攻，别挑衅端，遂